En Medellín, la vida y la jornada de la Madre discurrían alternamente entre la oración y el trabajo. Ya no podía salir a visitar las casas, debido a la parálisis que le arrebató el movimiento de los pies. Buena prueba para esta andariega de Dios. Sentada en su silla de manos se dedicaba al estudio y a la tarea de escribir para sus hijas. En cada carta, la Madre les mandaba el alma. A ratos, siempre en su silla de ruedas, iba recorriendo los pasadizos del convento para cerciorarse de la buena marcha de la comunidad o visitar acaso a otra religiosa enferma. Conducida por alguna de sus hijas, visitaba la capilla para conversar con su Señor o asistir en profundo recogimiento a los actos de comunidad y a los oficios divinos. Nunca se quejó de su inmovilidad, todo lo sufrió con paciencia y mansedumbre. Desde enero de 1949 su salud empezó a decaer notoriamente, día tras día. Sus fuerzas, antes inagotables, para el trabajo intelectual, iban disminuyendo y gustaba entonces de entretenerse en arreglar hilos y sedas para los indios, aunque se fatigaba. Le obsesionaban los salasacas del Ecuador. - Con estas hilitos, decía, compraremos salasaquitas.

En semana santa de 1949, le aparecieron en las piernas unos lamparones rojos que le causaban acerbo dolor. A pesar de ello, asistió, en cuanto pudo, a los divinos oficios y reunió varias veces a la comunidad para platicarle de cosas del espíritu. El domingo de Pascua, que fue siempre para ella día de júbilo, lo pasó llena de decaimiento y de tristeza. Hasta miró sin interés la hermosa estatua del resucitado que ese año se estrenaba. Para aliviar el estado de las piernas hinchadas acudieron varias médicos, entre ellos los doctores Luis Tirado Vélez, Ignacio Vélez Escobar y Alfonso Velásquez que emplearon tratamientos de penicilina, pero estos resultaron inútiles. Los médicos, a pesar de su voluntad de oro, hubieron de confesar: ¡Sólo un milagro puede curarla ! Y en las casas comenzaron novenas particulares al franciscano fray Martín de la Palma.